Тема курсовой работы  для 1- 2 студентов 1- 4 курсов ФББ МГУ        
                                            
Тьютор профессор/зав. лабораторией Любецкий Василий Александрович 

Институт проблем передачи информации РАН.
                                                                                                                                                                   
куратор из НИИ ФХБ или ФББ  внс В.В. Алешин.
как связаться: e-mail lyubetsk@iitp.ru, lyubetsk@mail.ru                                                                                                                                             		тел. 8-9104646917.
                                                                                                                                                                              .                         Тема работы: Модель классической аттенюаторной регуляции у бактерий

Характер работы (уточните; например: бионженерия; культуры клеток; анализ генома человека; программирование) 
‮ экспериментальная нет
‮ биоинформатика  в основном
‮ литературный отчасти обзор
Аннотация,  литература для введения в проблематику   
Регуляция экспрессии генов, в частности, означает включение и выключение транскрипции групп генов и относится к основным механизмам жизнедеятельности. Известно несколько механизмов регуляции, один из них - классическая аттенюаторная регуляция. Нами разработаны модель, компьютерная программа и сервер, которые служат для поиска методами биоинформатики участков генома, участвующих в регуляции, и также для вычисления зависимости экспрессии генов и, в конечном счете, активности соответствующих ферментов от концентрации регулирующей аминокислоты. Эта модель широко тестирована для триптофана, концентрация которого в клетке у многих видов бактерий регулируется с помощью аттенюации. Задача в том, чтобы для других аминокислот, концентрация которых регулируется аналогичным образом, проверить эту модель. А также - более тщательно учесть влияние инициации как транскрипции, так и трансляции. Предполагается прочесть статьи и работать с готовой компьютерной программой; или подбирать данные в соответствующих базах и анализировать результаты счета для них; или вносить изменения в модель и программу. В этих пределах конкретное содержание работы будет зависеть от того, с какого курса студент, какова его подготовка и от его выбора.
В.А. Любецкий, Л.И. Рубанов, А.В. Селиверстов, С.А. Пирогов. Model of gene expression regulation in bacteria via formation of RNA secondary structures, Молекулярная биология, т. 40, № 3, 2006, с. 497 - 511.
Lyubetsky V., Pirogov S., Rubanov L., Seliverstov A. Modeling classic attenuation regulation of gene expression in bacteria, 2007, Journal of Bioinformatics and Computational Biology, vol 5, no 1, Feb 2007.